רוב האנכונדרומות מדגימות קליטה חיובית במיפוי עצמות, אין לכך משמעות.
אין בדיקת דם ספציפית לזיהוי שפירות או אי-שפירות של אנכונדרומות. הקביעה של שפירות נשעית על סמך המראה הטיפוסי בצילומים.